Самые редкие языки России назвали ученые - вот те, у которых менее 10 носителей:

Уильтинский (орокский) язык на Сахалине. Негидальский и удэгейский языки в Хабаровском крае. Южноюкагирский язык в Якутии, южноселькупский язык в Томской области. Водский язык в Ленинградской области, йоканьгско-саамский и бабинский саамский в Мурманской области. Более того, два языка в России имеют всего по одному компетентному носителю - ительменский и медновский алеутский.